GPB 2014年第3-4期内容简介
2014年第3期Genomics, Proteomics & Bioinformatics(GPB)纸质版期刊已经出书,共揭晓文章7篇。本刊执行副主编胡松年博士(本所)研究组,就小鼠出生后大脑发育历程中转录组表达举行了研究,发明在未成年阶段基因表达最为活跃,为明确哺乳动物出生后大脑发育的分子机制提供了理论依据;
高友鹤博士(中国医学科学院)等研究了差别利尿剂对尿卵白质组的影响,发明利尿剂显著影响尿液中的一些生物标记物的表达,提醒未来生物标记物的研究应仔细评估药物的潜在影响;
马林博士(解放军医院)等研究了疾病相关基因calsequestrin 1 (CASQ1) 的多态性和热射。ㄖ囟戎惺睿┝俅仓副甑墓叵,发明SNPA175G与热射病显著相关,进一步的研究将有利于相识肌肉热应激历程中的钙调理分子机制;
Sudip Kundu博士(印度)等研发了一种新工具——C2Analyzer,可明确判断目的miRNA的结构和GO系统,同时,miRNA间的函数关系可以生涯以备未来用做功效网络剖析使用,该工具可在www.bioinformatics.org/c2analyzer免费下载使用;
宁康博士(中科院青岛生物能源与历程研究所)等研究差别的DNA提取要领对六味地黄丸的生物学组成因素判断的影响,为未来古板中药生物学研究提供了有用计划;高占成博士(北京大学人民医院)等对人类咽部微生物菌群举行了研究,以为它们可能在呼吸道熏染的预防中起起劲的;ぷ饔,这为此类疾病的治疗提供了新的思绪;
本期新增添数据库更新栏目,Peter K. Rogan博士(加拿大)指出之前揭晓在本刊2013年第2期的一个mRNA拼接突变剖析数据库软件现在可以提供网上效劳,使用地点为http://shannonpipeline.cytognomix.com。
第三期封面
2014年第4期GPB即将出书,包括1篇远景展望,2篇综述,1篇快迅和1篇要领文章。其中,由本刊副主编章张博士(本所)等撰写的远景展望,首次确定了Biocuration的中文翻译,指呈现在中国在本事域研究面临的挑战,很是值得思索和推进,具有很强的前瞻性; 同时简朴介绍了Biocuration国际聚会,为将于2015年4月23-26日在北京举行的第八届Biocuration国际聚会(Biocuration2015)预热。本所是Biocuration2015的协办单位,GPB也将以参展单位的身份参会,接待有兴趣的职员关注、加入。关于聚会更多详情请登陆http://biocuration2015.tilsi.org/。
神经系统疾病包括中枢神经系统中多种重大的疾病,由于很难靠近病理中心,因此这类疾病的基础和转化医学研究都受到了很大的限制。但随着现在测序手艺的飞速生长,使研究该类疾病的分子机制和生物学标记物成为了可能。本刊副主编雷红星博士(本所)研究组,就神经退行性疾病和神经发育障碍疾病,以研究最普遍的阿尔茨海默病和自闭症这两类最为严重的神经系统疾病为例,对最新基因组学研究希望举行了综述,很有针对性和指导意义。
重复DNA序列是真核基因组的主要组成部分,可能具有种属特异性,是分类学和系统爆发学研究的主要工具。Shweta Mehrotra博士(印度)等对植物核DNA重复序列在类型、漫衍、进化和功效上的最新研究情形举行了综述,随着基因组学手艺的前进,此类研究将能更好地资助人们相识重大真核生物的爆发、生长历程。
鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)是医院中一种十分主要的条件致病菌,其关于多种药物的耐药性近年来也有越来越多的报道,而质粒被以为与耐药性有关。因此,本刊编委岑岭博士(天津大学)等通过对Acinetobacter baumannii MDR-TJ的全序枚举行测序剖析,发明了一种新质粒——pABTJ2,并对该质粒举行了详细的剖析研究,以为其包括的多种噬菌体样元素和tRNA编码基因与耐药性有亲近关系,这将资助研究者们更好地研究Acinetobacter baumannii的耐药性。
剖析重大生物系统间相互作用的特征是卵白质间相互作用网络剖析和盘算生物学剖析的主要研究目的。Massimo Natale博士(意大利)等开发了一个Cytoscape2.8版本的插件——FunMod,可挖掘无偏向性的卵白相互作用的网络数据、推断相互作用卵白的子网络数据、发明与疾病相关的通路,并通过拓扑结构剖析来形貌各个卵白及其相关的生物学通路,以资助人们更好地举行相关数据的判读、剖析。
另外,GPB将在明年4月出书“Biomarkers for Autoimmune Diseases”的专刊,由University of Texas Southwestern Medical Center的Edward Wakeland博士和Quan-Zhen Li博士配合担当Guest editors,接待各人起劲投稿,详情请审查Call for paper。
以上两期文章全文均可在GPB主页(http://www.elsevier.com/locate/gpb)或ScienceDirect数据库(www.sciencedirect.com/science/journal/16720229)中浏览下载,接待各人阅读、引用。
第四期封面
敬请期待—GPB 10月出书Translational Omics专刊
GPB将在下一期(2014年第5期)出书“Translational Omics”的专刊,由本刊副主编偏向东博士(本所)和本刊编委Andreas Keller博士(德国Saarland University)配合担当Guest editors。现在已吸收的稿件中,包括来自Ashok Amin博士(美国Virginia Tech)、祁鸣博士(美国University of Rochester Medical Center/深圳华大基因/浙大医学院第一隶属医院/沃森基因)、吕有勇博士(北大)、饶绍奇博士(广东医学院)和严江伟博士(本所)的文章,内容涉及基因组学、卵白质组学及生物信息学手艺在肿瘤等疾病及法医学方面的应用,均为约请来稿=哟魅斯刈⒈咀。