北京基因组所(国家生物信息中心)多组学数据资源系统建设一连取得主要希望
克日,兴发娱乐(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(CNCB-NGDC)的多组学数据资源系统年度效果在国际生物数据库顶级期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线揭晓。至此,CNCB-NGDC共有10篇论文入选将于2023年1月正式出书的《核酸研究》2023年度数据库专刊,在生物数据库领域继续位于国际第一方阵。
2022年,CNCB-NGDC与共建单位以及30多家相助单位亲近相助,一连更新和完善焦点数据库资源(GSA、GWH、GVM、GEN、MethBank、LncRNA、RCoV19等),并开发了多个全新数据库(基因序列数据库GenBase,猴痘病毒基因组信息库MpoxVR,新冠病毒知识图谱数据库KGCoV,原核生物泛基因组数据库ProPan,人类癌症可变剪接知识库ASCancer Atlas,全转录组关联研究知识库TWAS Atlas,脑数据资源库Brain Catalog,个体癌症基因组数据库CCAS,同源基因数据库HGD,热带作物组学数据库TCOD等),进一步拓展了涵盖基础组学、国家人类遗传、主要战略生物、病毒等资源信息库以及生物信息在线剖析工具等在内的多组学数据资源系统,为国家基因组科学数据的汇交共享、清静治理和挖掘使用提供了主要支持。
CNCB-NGDC汇聚全球数据,免费为海内外用户提供一站式多组学数据汇交和存储效劳,宣布的数据编号被Springer Nature、Elsevier、Wiley、Taylor & Francis、Cell等全球主要出书集团认可。阻止2022年12月20日,组学原始数据治理系统(GSA Family)已支持种种科技项目10900多个,汇交数据量近19PB,来自754家单位3500名用户,相关数据已揭晓在457种海内外期刊的近2000篇文章。2022年7月起CNCB-NGDC肩负国家人类遗传资源信息治理备份平台运行维护使命,实现国家人类遗传资源信息一体化治理、备份、宣布与共享。新冠病毒信息库(RCoV19)一直更新,现在已收录新冠病毒序列超1400万条,为全球181个国家/地区240多万名访客提供数据效劳,累计数据下载达100多亿条,在新冠病毒演化剖析、监测、溯源等方面施展了主要作用,入选2022年天下互联网领先科技效果手册。
CNCB-NGDC的建设获得科技部、财务部、兴发娱乐、国家自然科学基金委、一带一起国际科学组织同盟、国际生物科学团结会等的资助。
CNCB-NGDC在《核酸研究》2023年数据库专刊揭晓的论文:
1.CNCB-NGDC数据库资源(整体介绍文章)
2.原核生物泛基因组数据库ProPan
3.全转录组关联研究知识库TWAS Atlas
4.细胞分类库Cell Taxonomy
5.同源基因数据库HGD
6.人类癌症可变剪接知识库ASCancer Atlas
7.脑数据资源库Brain Catalog
8.动植物基因组变异与表型关联知识库GWAS Atlas v2.0
9.DNA甲基化数据库MethBank 4.0
10.人类长非编码RNA数据库LncBook 2.0
CNCB-NGDC多组学数据资源系统(Nucleic Acids Res 2023)
GSA数据增添图